分子生物學的中心法則與序列轉換
在分子生物學中，遺傳訊息的流動遵循著中心法則：去氧核糖核酸（DNA）經由轉錄作用合成核糖核酸（RNA），再經由轉譯作用合成蛋白質。在轉錄過程中，細胞以 DNA 為模板合成 RNA。本工具提供便捷的線上轉換管道，讓您能將 DNA 序列轉換為 RNA，或將 RNA 序列反轉錄回 DNA。
您的序列會在瀏覽器本機進行轉換，不會上傳到 BroBroGo。
編碼股與模板股的轉換機制
進行核酸序列轉換時，必須根據您所擁有的 DNA 股別來選擇正確的轉換規則。DNA 雙股依據其在轉錄時的功能，可分為以下兩種：
- 編碼股（有義股）：此股的序列與轉錄產生的 RNA 序列幾乎完全相同，唯一的差別在於 DNA 中的胸腺嘧啶（T）在 RNA 中會被尿嘧啶（U）取代。
- 模板股（反義股）：此股是轉錄時 RNA 聚合酶實際閱讀並進行互補配對的股。
本工具支援以下兩種轉換方向與股別規則：
| 轉換方向 | 股別選擇 | 轉換規則 |
|---|---|---|
| DNA → RNA | 編碼股（有義股） | 所有的 T 轉換為 U，其餘鹼基保持不變。 |
| DNA → RNA | 模板股（反義股） | 進行互補配對：A→U、T→A、C→G、G→C。 |
| RNA → DNA | 編碼股（有義股） | 所有的 U 轉換為 T，其餘鹼基保持不變。 |
| RNA → DNA | 模板股（反義股） | 進行互補配對：A→T、U→A、C→G、G→C。 |
在轉換過程中，英文小寫字母會保持小寫狀態，而對齊空位標記（-）也會被完整保留。
IUPAC 簡併鹼基代號與互補規則
在生物資訊學中，序列常包含簡併鹼基代號以表示該位置可能存在多種不同的鹼基。本工具完整支援標準的 IUPAC-IUB 簡併核酸代號。
當選擇「編碼股（有義股）」時，簡併代號保持不變。當選擇「模板股（反義股）」時，簡併代號會依據 1984 年國際純粹與應用化學聯合會（IUPAC）的規範進行互補配對轉換：
R（嘌呤：A/G）與Y（嘧啶：C/T/U）互補：R↔YK（酮基：G/T/U）與M（氨基：A/C）互補：K↔MB（非 A）與V（非 T/U）互補：B↔VD（非 C）與H（非 G）互補：D↔HS（強鍵：G/C）、W（弱鍵：A/T/U）以及N（任意鹼基）為自身互補，因此保持不變。
FASTA 格式與輸入字元處理
本工具支援標準的 FASTA 格式輸入。FASTA 格式是一種基於文字的序列表示法，其特徵如下：
- 名稱行：以
>開頭的行（或依據舊式 FASTA 註解規範以;開頭的行）會被視為名稱行。 - 單一名稱行：若輸入中僅包含一行名稱行，該行會被完整保留並顯示於結果上方，系統會顯示提示訊息：
已保留名稱行。。 - 複數名稱行：若偵測到多個名稱行，系統會將所有序列行合併為單一序列，並顯示提示訊息：
偵測到 ‹n› 行名稱行——序列行已合併為單一序列。。
輸入限制與字元過濾規則如下：
- 長度限制：原始輸入序列必須控制在 2,000,000 個字元以內，否則會觸發錯誤訊息：
該序列對此工具而言太長了。請控制在 ‹max› 個字元以內。。 - 自動忽略字元：所有的空格、換行、數字和標點符號都會被自動忽略並從序列中移除，系統會顯示提示訊息：
已忽略 ‹n› 個空格、數字和標點符號。。 - 不支援的字元：若輸入包含非允許的鹼基字母，系統會顯示錯誤訊息：
不支援的字母：‹chars›。僅允許輸入 DNA/RNA 鹼基字母。（最多列出前 6 個不支援的字元）。
GC 含量的計算與意義
GC 含量是指序列中鳥嘌呤（G）與胞嘧啶（C）所佔的百分比，這在引子設計、聚合酶連鎖反應（PCR）及基因組分析中是極為重要的參數。本工具的 GC 含量計算公式如下：
GC 含量 = (G + C + S) / (A + C + G + T + U + W + S) × 100%
在此公式中，簡併代號 S（強鍵：G 或 C）會被計入 GC 總數，而 W（弱鍵：A 或 T/U）則計入 AT 總數。其他簡併代號（如 R、Y、K、M、B、V、D、H、N）由於其 GC 貢獻無法確定，因此不納入分子與分母計算。若序列中不含任何可計算的鹼基，則不顯示百分比。
由於簡單的 T ↔ U 轉換不影響鹼基類別，且模板股互補轉換僅在同類別內進行（如 G ↔ C），因此轉換前後的 GC 含量數值會保持一致。
常見問題
FASTA 標頭、數字和空格會如何處理？
以 > 開頭的名稱行會被保留並顯示在結果上方。空格、換行、數字和標點符號會被忽略，且輸入框下方的提示會告訴您移除了多少字元——絕不會在不告知的情況下直接丟棄任何內容。
我可以貼上像 N、R 或 Y 這類的簡併代號嗎？
會。簡併 IUPAC 鹼基代號會被保留：一般的轉換只會處理 T 和 U，而模板股轉換則會將每個代號對應到其正確的互補鹼基（R↔Y、K↔M；S、W 和 N 保持不變）。對齊空位標記（-）會保留，且英文小寫字母也會保持小寫。
編碼股與模板股有什麼不同？
編碼股（有義股）與信使 RNA（mRNA）一致，唯獨 T 會變成 U。模板股（反義股）則是細胞實際進行轉錄閱讀的股，因此每個鹼基都會進行互補配對：A→U、T→A、C→G、G→C。請選擇與您貼上的序列書寫方向相符的股。
RNA → DNA 會產生什麼結果？
這會產生您 RNA 的 DNA 複本：每個 U 都會變成 T，其他內容保持不變。這就是反轉錄酶會產生的 cDNA 序列，當後續使用的工具僅接受 DNA 時非常有用。